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揭示埃博拉病毒在宿主內的進化模式

中國科學院微生物研究所、中國人民解放軍軍事醫學科學院、首都醫科大學附屬北京地壇醫院等單位科研人員合作開展的埃博拉病毒宿主內進化研究取得重大突破。該研究首次系統地揭示了埃博拉病毒在宿主內的進化模式,重新闡明了病毒基因中重要變異位點在“病毒—宿主”相互影響中的作用,為抗病毒藥物研發設計藥物靶標提供了新依據。該研究論文近日在線發表在《自然·微生物學》雜志上。

該論文并列作者、首都醫科大學附屬北京地壇醫院傳染病研究所陳晨博士介紹,研究團隊采用擴增子深度測序,并為此開發了一套全新的生物信息學分析流程,通過對135個樣本的測定,次發現了埃博拉病毒在宿主內進化過程中曾經產生的710個單核苷酸變異位點。

“如果說人體內有10000個埃博拉病毒,運用傳統的分析研究方法,只有當體內6000個甚至8000個病毒發生變化時才能監測到病毒變化,而通過此次設計的生物信息學分析流程,只要人體內2個~5個病毒發生變化就能監測到。”陳晨介紹,借助方法學的突破,可以在臨床上更早、更地發現病毒變異,為后期用藥提供指導。同時,研究團隊還發現,病毒VP40基因受到了強烈的負選擇,這為抗病毒藥物設計提供了新靶點。

中國科學院微生物研究所劉文軍研究員認為,本研究“從個體內種群變異這一嶄新角度,解讀了病毒的進化規律,是宿主內進化這一病毒學前沿領域的重大突破”。(齊一生物www.qiyibio.com)

據介紹,在公共衛生領域,該研究可為埃博拉疫情暴發提供評估依據;在臨床研究方面,高通量檢測技術的快速普及,可推動臨床新發傳染病控制和傳染病用藥。


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